Rpa 179 号会员
  •  2 回帖  •  1.9K 浏览  •  2019-07-31 23:16:59

Python 实现对各种数据文件的操作

本文总结使用 Python 对常见的数据文件进行读写操作。帖子中的内容有些来自于他人，这里做了些整理，希望能有帮助。

常见的数据文件类型如下：
* txt
* csv
* excel(xls\xlsx)
* 在线网页数据
* pdf\word
* 其他数据软件格式

1 txt 文件

更多官方参考：https://docs.python.org/3/tutorial/inputoutput.html#reading-and-writing-files

文件读取

# 文件input
file_txt = os.path.join(workdir,'Data/demo_text.txt')

# 打开文件
f = open(file_txt, encoding='utf-8')

# 将每行的文本读取，并存为列表
# 此处使用.rstrip()去除空格、换行符
lines_raw = [x.rstrip() for x in f]
# 或者
# lines_raw = [l.rstrip() for l in f.readlines()]

print(lines_raw)

# 关闭文件
f.close()

也可以用 pandas 来读取

df_txt = pd.read_csv(file_txt, names=['txt'], encoding='utf-8')
df_txt.head()

文件输出

# 文件output
file_out = os.path.join(workdir,'Data/out_text.txt')

f_out = open(file_out, encoding='utf-8',mode = 'w')

f_out.writelines(lines_raw)
f_out.close()

2 csv 文件

更多参考：https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/reference/api/pandas.read_csv.html#pandas.read_csv

csv 文件的读入和写出相对简单，直接调用 pandas 的函数即可。

# 定义文件路径
file_csv = os.path.join(workdir,'Data/demo_csv.csv')

# pandas.read_csv()函数来读取文件
df_csv = pd.read_csv(file_csv,sep=',',encoding='utf-8')

# dataframe.to_csv()保存csv文件
df_csv.to_csv('out_csv.csv',index=False,encoding='utf-8')

# 查看dataframe前3行
df_csv.head(3)

这里也可以把 csv 当做文本文件来读取，不过处理过程稍微复杂点，尤其是字段内的取值中含有分隔符 (比如逗号) 时，例如上面的name字段。

3 excel(xls\xlsx) 文件

pandas 工具包中也提供了相应的函数来读写 excel 文件 (pandas.read_excel()和dataframe.to_excel())。

更多参考：https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/reference/api/pandas.read_excel.html#pandas.read_excel

不同于 csv 文件，xlsx 文件中会有多个 sheet，pandas.read_excel 函数默认读取第一个 sheet.

# 定义文件路径
file_excel = os.path.join(workdir,'Data/demo_xlsx.xlsx')

# pandas.read_excel()函数来读取文件
# sheet_name=0表示读取第一个sheet，也可以指定要读取的sheet的名称(字符串格式)
# header=0 表示使用第一行作为表头(列名)
# 如果数据中没有列名(表头)，可以设置header=None,同时names参数来指定list格式的列名
df_excel = pd.read_excel(file_excel,sheet_name=0,header=0,encoding='utf-8')

# dataframe.to_csv()保存csv文件
df_excel.to_excel('out_excel.xlsx',index=False,encoding='utf-8')

# 查看dataframe前3行
df_excel.head(3)

如果我们是想在单元格颗粒度上进行操作，可以考虑两个工具包, 我在之前的帖子有讲过可以查看：

import xlwings as xw

file_excel = os.path.join(workdir,'Data/demo_填表.xlsx')

# 打开excel文件的时候不要展示页面
app = xw.App(visible=False)

# 打开工作簿
wb = xw.Book(file_excel)

# 打开工作表
# 可以用index，可以指定sheet的名称
ws = wb.sheets[0]

# 读取对应单元格的值
print(ws.range('A1').value)

ws.range('B1').value = 'Ahong'
ws.range('B2').value  = '男'
ws.range('B3').value  = 'Pyhon'

# 保存工作簿
wb.save() 
# 也可以保存为新的文件名，e.g.wb.save('new.xlsx')

# 关闭工作簿
wb.close()

如果要批量从多个统一格式的 excel 文件中读取多个单元格或者写入数据，不妨考虑此方法。

4 在线网页数据

在线网页数据通常需要网络爬虫来抓取，同时网页是半结构化的数据，需要整理为结构化的数据。

注：关于网络爬虫可以参考 O’REILLY 的书 Web Scraping with Python: Collecting More Data from the Modern Web).

网页数据的爬取和解析常会用到的工具包：

通常网络爬虫的步骤如下：

  1. 分析网页请求规范，比如是 get 还是 post，请求的 url 是啥，返回的数据是什么格式 (json? 静态 html?)，header 参数，url 或者 post 中的变量有什么等；

  2. 获取网页数据，使用 requests 包；

  3. 解析网页数据 (将半结构化的网页数据转化为结构化数据)，BeautifulSoup、lxml、re、json 齐上阵；

  4. 整合数据并存档，使用 pandas 对数据进行整合并初步清洗。

5 PDF\Word

5.1 读取 PDF 文件

对于 pdf 文件而言，如果要对文档操作 (比如合并、筛选、删除页面等)，建议使用的工具包：

更多官方参考：https://www.binpress.com/manipulate-pdf-python/

处理 pdf 文件时，要注意文件需要是“已解密”或者“无密码”状态，“加密”状态的文件处理时会报错。

pdf 解密工具推荐：

这里举例说明 PyPDF2 的用法，筛选奇数页面并保存为新文档。

import PyPDF2

# 读入文件路径
file_in = os.path.join(workdir,'Data/demo_pdf.pdf')
# 打开要读取的pdf文件
f_in = open(file_in,'rb') 

# 读取pdf文档信息
pdfReader = PyPDF2.PdfFileReader(f_in)

# pdf文件页面数
page_cnt = pdfReader.getNumPages()

pdfWriter = PyPDF2.PdfFileWriter()

# 筛选奇数页面
for page_idx in range(0,page_cnt,2):
    page = pdfReader.getPage(page_idx)
    pdfWriter.addPage(page)

# 输出文档
file_out = open('pdf_out.pdf', 'wb')
pdfWriter.write(file_out)

# 关闭输出的文件
file_out.close()

# 关闭读入的文件
pdf_file.close()

如果要解析 pdf 文件的页面数据 (文件上都写了啥)，推荐的工具包为：

安装好pdfminer.six后，直接在命令行中调用如下命令即可：

pdf2txt.py demo_pdf.pdf -o demo_pdf.txt

或者参考 _https://stackoverflow.com/questions/26494211/extracting-text-from-a-pdf-file-using-pdfminer-in-python_ 可以自定义一个函数批量对 pdf 进行转换 (文末附有该函数)。

textract使用示例如下：

import textract

# 文件路径
file_pdf = os.path.join(workdir,'Data/demo_pdf.pdf')

# 提取文本
text_raw = textract.process(file_pdf)
# 转码
text = text_raw.decode('utf-8')

5.2 读取 Word 文件

可以使用工具包python-docx,https://python-docx.readthedocs.io/en/latest/

操作 word 的场景相对少见，参考网站的示例即可。

6 其他数据软件文件

比如 SAS, SPSS,Stata 等分析软件导出的数据格式。

可以使用的工具包pyreadstat, https://github.com/Roche/pyreadstat

# 使用Python读取.sav文件
# https://github.com/Roche/pyreadstat
import pyreadstat

# 文件路径
file_data = os.path.join(workdir,'Data/demo_sav.sav')

# 读取文件
df,meta = pyreadstat.read_sav(file_data)
# df就是转化后的数据框

# 查看编码格式
print(meta.file_encoding)

df.head()

# 使用 Python 读取.sav 文件
# https://github.com/Roche/pyreadstat
import pyreadstat

# 文件路径
file_data = os.path.join(workdir,‘Data/demo_sav.sav’)

# 读取文件
df,meta = pyreadstat.read_sav(file_data)
# df 就是转化后的数据框

# 查看编码格式
print(meta.file_encoding)

df.head()

# ref: https://stackoverflow.com/questions/26494211/extracting-text-from-a-pdf-file-using-pdfminer-in-python

from pdfminer.pdfinterp import PDFResourceManager, PDFPageInterpreter
from pdfminer.converter import TextConverter
from pdfminer.layout import LAParams
from pdfminer.pdfpage import PDFPage
from io import StringIO

def convert_pdf_to_txt(path):
    rsrcmgr = PDFResourceManager()
    retstr = StringIO()
    codec = 'utf-8'
    laparams = LAParams()
    device = TextConverter(rsrcmgr, retstr, codec=codec, laparams=laparams)
    fp = open(path, 'rb')
    interpreter = PDFPageInterpreter(rsrcmgr, device)
    password = ""
    maxpages = 0
    caching = True
    pagenos=set()

    for page in PDFPage.get_pages(fp, pagenos, maxpages=maxpages, password=password,caching=caching, check_extractable=True):
        interpreter.process_page(page)

    text = retstr.getvalue()

    fp.close()
    device.close()
    retstr.close()
    return text